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北京畜牧獸醫研究所豬遺傳育種團隊發現豬種質資源特色性狀耳大小的重要錯義突變

2019-04-01 08:55:00 來源:中國農業科學院北京畜牧獸醫研究所

  近日,我所豬遺傳育種科技創新團隊發現豬種質資源特色性狀耳大小的重要錯義突變,為進一步研究控制豬耳大小的分子機制提供了重要信息,并為豬品種遺傳資源研究提供了參考。

  豬耳大小存在著巨大的多樣性,這是豬品種資源的一個重要形態學特征,特別是在地方豬種中可作為重要的遺傳標記。牧醫所豬遺傳育種團隊在豬5號染色體上定位了4個影響豬耳大小的關鍵候選基因:HMGA2、LEMD3、MSRB3和WIF1,并克隆分析了LEMD3和MSBR3基因。利用RACE技術得到WIF1和HMGA2基因的cDNA全長序列,發現WIF1基因在60日齡的豬耳軟骨中表達量最高。通過變異位點篩選,在WIF1基因中發現一個保守的錯義突變位點(WIF1: c.1167C>G)位于其編碼蛋白的表皮樣生長因子結構域中。進一步關聯分析發現該突變在北京黑豬群體和大白豬×民豬雜交群體中都與耳面積顯著關聯。當把該位點作為固定效應納入模型重新在大白×民豬群體中進行GWAS時,SSC5上峰值SNP的P-value顯著下降。因此,WIF1: c.1167C>G可能是與豬耳大小相關的一個重要突變。

  相關成果已發表在動物科學top25%期刊《Animal Genetics》上。我所博士生梁晶和張躍博為共同第一作者,張龍超副研究員和王立賢研究員為通訊作者。

  原文鏈接:https://doi.org/10.1111/age.12759

 

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